Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP3Q9Y6F1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms