Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX8Q9Y5X2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX8Q9Y5X2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms