Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms