Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP15Q9Y4E8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP15Q9Y4E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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