Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
RAD54L2Q9Y4B4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAD54L2Q9Y4B4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms