Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms