Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG6Q9Y2V7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG6Q9Y2V7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms