Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms