Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP2BQ9UQN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2BQ9UQN3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms