Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms