Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN8AQ9UQD0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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