Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHOC2Q9UQ13 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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