Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDZRN3Q9UPQ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms