Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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