Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYO6Q9UM54 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYO6Q9UM54 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms