Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms