Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms