Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPA4Q9UI42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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