Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHORDC1Q9UHD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms