Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms