Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms