Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAJB4Q9UDY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB4Q9UDY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms