Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC6Q9UBN7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms