Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG4Q9UBN1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms