Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms