Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP35Q9P2H5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP35Q9P2H5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
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