Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC88CQ9P219 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC88CQ9P219 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms