Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD4Q9NZQ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms