Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2L1Q9NZI6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFCP2L1Q9NZI6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms