Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP1Q9NZI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms