Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZA1

CLIC5, Chloride intracellular channel protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC5Q9NZA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC5Q9NZA1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLIC5Q9NZA1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC5Q9NZA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms