Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms