Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX43Q9NXZ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX43Q9NXZ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX43Q9NXZ2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms