Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 391.3 ms