Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPMQ9NSP4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms