Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms