Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms