Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRN4Q9NRL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms