Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPNPEP3Q9NQH7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms