Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms