Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED4Q9NPJ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms