Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms