Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf33Q9H7E9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms