Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO44Q9H4M3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO44Q9H4M3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms