Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIL1Q9H173 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SIL1Q9H173 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms