Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49AQ9H0Q0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms