Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC113Q9H0I3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms