Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP44Q9H0E7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms