Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF541Q9H0D2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms