Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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